Застенчивая старшеклассница Май Нанасэ знакомится с другом своего брата, Сотой Нисино, который моментально в нее влюбляется. Они начинают встречаться, но вскоре двоюродный брат Соты Итуски Кага тоже заинтересовывается Май.
Атомная подлодка «Ямато» после победы над Седьмым флотом США держит курс на Нью-Йорк, выполняя опасную миссию. У Берингова пролива за ней следует новейшая американская субмарина, пытаясь уничтожить её. На фоне политического напряжения и предстоящих выборов премьер-министр Японии оказывает поддержку экипажу. Для капитана Каэды это задание становится настоящей проверкой на прочность.
В разгар Холодной войны японские и американские силы объединяются для создания передовой ядерной подводной лодки, способной изменить стратегический баланс мировой политики. Пока инженеры и военные сосредоточены на технических аспектах проекта, они неожиданно оказываются втянутыми в мир шпионажа и международных интриг. Подводная лодка становится центром ожесточенной борьбы разведслужб разных стран, каждая из которых стремится заполучить эту передовую технологию.
